Технологию можно использовать для определения влияния генетической архитектуры на заболевания органов зрения.
Сотрудники Национального института глаз сумели изучить организацию хроматина клеток сетчатки. Это позволит изучить влияние генетической архитектуры на развитие заболеваний, вызывающих потерю зрения. Результаты исследования появились в Nature Communications.
Клетки сетчатки взрослого человека не делятся, поэтому представляют стабильный объект для изучения. Хроматин служит для упаковки длинных нитей ДНК и создания точек контакта между генетическими последовательностями и супер энхансера ми и факторами транскрипции. В новой работе ученые использовали метод глубокого секвенирования для изучения трехмерной организации генома. Они сумели получить карту из 704 миллионов контактных точек в хроматине сетчатки.
Результаты объединили с данными о генах сетчатки и регуляторных элементах, что позволило получить представление о взаимодействии внутри хроматина. Оказалось, что его организация играет важную роль в регуляции генов, отвечающих за специфические ткани.
Ученые отметили, что более 35% пар генов, взаимодействующих через хроматиновую петлю у мышей, присутствовали в сетчатке человека. Кроме того, полученные данные помогли выделить гены-кандидаты, которые связаны с развитием слепоты.
